时空的一瞬间扭曲，给原本平静的宇宙带来了毁灭性的打击；原本只存在于特摄剧中的怪兽出现在热闹的大都市内肆意破坏，而英雄却迟迟未来？“奥特曼也许会迟到，但绝对不会不来！”这是一个少年意外获得新生的奥特曼，奈迦的力量之后拼命地保护着他所深爱着的地球的故事...
